Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EIF3BP55884 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EIF3BP55884 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms