Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX9P55771 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX9P55771 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX9P55771 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX9P55771 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX9P55771 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX9P55771 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX9P55771 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX9P55771 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX9P55771 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX9P55771 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX9P55771 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX9P55771 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX9P55771 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX9P55771 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX9P55771 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAX9P55771 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX9P55771 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX9P55771 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX9P55771 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX9P55771 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX9P55771 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX9P55771 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX9P55771 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX9P55771 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAX9P55771 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX9P55771 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX9P55771 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX9P55771 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX9P55771 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX9P55771 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX9P55771 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX9P55771 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX9P55771 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX9P55771 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PAX9P55771 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PAX9P55771 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PAX9P55771 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAX9P55771 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX9P55771 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX9P55771 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX9P55771 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX9P55771 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX9P55771 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX9P55771 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX9P55771 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX9P55771 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX9P55771 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX9P55771 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX9P55771 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX9P55771 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX9P55771 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX9P55771 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX9P55771 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX9P55771 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAX9P55771 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX9P55771 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX9P55771 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX9P55771 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX9P55771 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX9P55771 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX9P55771 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX9P55771 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX9P55771 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX9P55771 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX9P55771 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX9P55771 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX9P55771 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX9P55771 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX9P55771 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX9P55771 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX9P55771 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX9P55771 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX9P55771 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX9P55771 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAX9P55771 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms