Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH8P55286 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH8P55286 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH8P55286 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH8P55286 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH8P55286 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH8P55286 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH8P55286 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH8P55286 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH8P55286 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH8P55286 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH8P55286 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH8P55286 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH8P55286 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH8P55286 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH8P55286 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH8P55286 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH8P55286 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH8P55286 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH8P55286 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH8P55286 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH8P55286 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH8P55286 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH8P55286 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH8P55286 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH8P55286 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH8P55286 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH8P55286 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDH8P55286 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH8P55286 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH8P55286 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH8P55286 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH8P55286 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH8P55286 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH8P55286 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH8P55286 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH8P55286 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH8P55286 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH8P55286 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH8P55286 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH8P55286 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH8P55286 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH8P55286 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH8P55286 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH8P55286 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH8P55286 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH8P55286 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH8P55286 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH8P55286 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH8P55286 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH8P55286 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH8P55286 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH8P55286 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH8P55286 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH8P55286 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH8P55286 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH8P55286 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH8P55286 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH8P55286 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH8P55286 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH8P55286 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH8P55286 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH8P55286 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH8P55286 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH8P55286 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH8P55286 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH8P55286 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH8P55286 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH8P55286 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH8P55286 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH8P55286 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH8P55286 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH8P55286 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH8P55286 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH8P55286 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH8P55286 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH8P55286 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH8P55286 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH8P55286 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH8P55286 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH8P55286 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH8P55286 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH8P55286 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH8P55286 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH8P55286 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH8P55286 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH8P55286 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH8P55286 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH8P55286 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH8P55286 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH8P55286 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH8P55286 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH8P55286 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH8P55286 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH8P55286 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH8P55286 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH8P55286 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH8P55286 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH8P55286 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDH8P55286 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms