Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRLP54845 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRLP54845 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRLP54845 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NRLP54845 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRLP54845 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NRLP54845 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRLP54845 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRLP54845 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRLP54845 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRLP54845 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRLP54845 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRLP54845 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRLP54845 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NRLP54845 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NRLP54845 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRLP54845 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRLP54845 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRLP54845 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRLP54845 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NRLP54845 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRLP54845 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRLP54845 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRLP54845 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRLP54845 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRLP54845 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NRLP54845 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRLP54845 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRLP54845 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRLP54845 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRLP54845 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRLP54845 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRLP54845 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRLP54845 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRLP54845 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRLP54845 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRLP54845 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRLP54845 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NRLP54845 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRLP54845 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRLP54845 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRLP54845 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRLP54845 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRLP54845 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRLP54845 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRLP54845 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NRLP54845 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NRLP54845 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRLP54845 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRLP54845 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRLP54845 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRLP54845 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRLP54845 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRLP54845 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRLP54845 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRLP54845 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRLP54845 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRLP54845 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRLP54845 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRLP54845 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRLP54845 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRLP54845 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRLP54845 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRLP54845 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRLP54845 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRLP54845 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRLP54845 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRLP54845 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRLP54845 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRLP54845 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRLP54845 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRLP54845 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRLP54845 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRLP54845 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRLP54845 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NRLP54845 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NRLP54845 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRLP54845 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRLP54845 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRLP54845 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRLP54845 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NRLP54845 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRLP54845 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRLP54845 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRLP54845 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRLP54845 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRLP54845 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRLP54845 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRLP54845 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRLP54845 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRLP54845 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRLP54845 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRLP54845 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRLP54845 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NRLP54845 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NRLP54845 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRLP54845 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRLP54845 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRLP54845 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NRLP54845 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms