Protein–RNA interactions for Protein: P54821

PRRX1, Paired mesoderm homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1P54821 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRRX1P54821 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRRX1P54821 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRRX1P54821 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRRX1P54821 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRRX1P54821 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRRX1P54821 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRRX1P54821 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRRX1P54821 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRRX1P54821 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRRX1P54821 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms