Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKAA2P54646 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKAA2P54646 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms