Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF138P52744 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF138P52744 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms