Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK3P51956 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK3P51956 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK3P51956 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK3P51956 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK3P51956 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEK3P51956 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK3P51956 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK3P51956 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK3P51956 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK3P51956 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK3P51956 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK3P51956 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK3P51956 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK3P51956 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK3P51956 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK3P51956 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK3P51956 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEK3P51956 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK3P51956 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK3P51956 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK3P51956 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK3P51956 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK3P51956 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK3P51956 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK3P51956 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK3P51956 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK3P51956 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK3P51956 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK3P51956 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK3P51956 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK3P51956 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK3P51956 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK3P51956 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEK3P51956 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK3P51956 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK3P51956 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK3P51956 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK3P51956 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK3P51956 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK3P51956 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK3P51956 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK3P51956 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK3P51956 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK3P51956 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEK3P51956 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEK3P51956 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEK3P51956 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEK3P51956 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK3P51956 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK3P51956 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK3P51956 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK3P51956 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK3P51956 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK3P51956 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK3P51956 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK3P51956 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK3P51956 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK3P51956 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEK3P51956 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK3P51956 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK3P51956 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK3P51956 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK3P51956 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK3P51956 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK3P51956 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK3P51956 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK3P51956 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK3P51956 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK3P51956 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK3P51956 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEK3P51956 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK3P51956 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK3P51956 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK3P51956 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK3P51956 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK3P51956 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK3P51956 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK3P51956 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK3P51956 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK3P51956 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK3P51956 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK3P51956 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK3P51956 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEK3P51956 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK3P51956 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK3P51956 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK3P51956 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK3P51956 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK3P51956 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK3P51956 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK3P51956 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK3P51956 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK3P51956 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK3P51956 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK3P51956 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK3P51956 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEK3P51956 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK3P51956 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK3P51956 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms