Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB27AP51159 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB27AP51159 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms