Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCAMP50895 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCAMP50895 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCAMP50895 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BCAMP50895 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCAMP50895 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCAMP50895 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BCAMP50895 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCAMP50895 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCAMP50895 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCAMP50895 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCAMP50895 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCAMP50895 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCAMP50895 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BCAMP50895 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BCAMP50895 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BCAMP50895 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BCAMP50895 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BCAMP50895 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BCAMP50895 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BCAMP50895 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BCAMP50895 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BCAMP50895 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BCAMP50895 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BCAMP50895 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BCAMP50895 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BCAMP50895 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BCAMP50895 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BCAMP50895 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BCAMP50895 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BCAMP50895 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BCAMP50895 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BCAMP50895 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BCAMP50895 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BCAMP50895 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BCAMP50895 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BCAMP50895 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BCAMP50895 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BCAMP50895 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BCAMP50895 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BCAMP50895 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BCAMP50895 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
BCAMP50895 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BCAMP50895 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BCAMP50895 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BCAMP50895 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BCAMP50895 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BCAMP50895 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BCAMP50895 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BCAMP50895 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BCAMP50895 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BCAMP50895 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BCAMP50895 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BCAMP50895 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BCAMP50895 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCAMP50895 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCAMP50895 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCAMP50895 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCAMP50895 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCAMP50895 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BCAMP50895 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCAMP50895 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCAMP50895 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCAMP50895 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCAMP50895 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCAMP50895 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCAMP50895 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCAMP50895 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCAMP50895 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCAMP50895 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCAMP50895 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BCAMP50895 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BCAMP50895 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BCAMP50895 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BCAMP50895 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BCAMP50895 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BCAMP50895 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BCAMP50895 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BCAMP50895 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BCAMP50895 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BCAMP50895 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCAMP50895 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCAMP50895 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCAMP50895 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCAMP50895 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCAMP50895 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCAMP50895 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCAMP50895 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCAMP50895 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCAMP50895 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCAMP50895 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCAMP50895 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCAMP50895 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCAMP50895 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCAMP50895 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCAMP50895 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCAMP50895 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCAMP50895 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCAMP50895 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCAMP50895 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms