Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NUP153P49790 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NUP153P49790 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NUP153P49790 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NUP153P49790 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NUP153P49790 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NUP153P49790 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NUP153P49790 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NUP153P49790 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NUP153P49790 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NUP153P49790 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NUP153P49790 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NUP153P49790 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NUP153P49790 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
NUP153P49790 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NUP153P49790 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
NUP153P49790 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NUP153P49790 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NUP153P49790 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
NUP153P49790 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NUP153P49790 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NUP153P49790 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NUP153P49790 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NUP153P49790 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NUP153P49790 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
NUP153P49790 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NUP153P49790 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NUP153P49790 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NUP153P49790 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NUP153P49790 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NUP153P49790 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NUP153P49790 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NUP153P49790 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NUP153P49790 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NUP153P49790 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NUP153P49790 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NUP153P49790 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NUP153P49790 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
NUP153P49790 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NUP153P49790 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NUP153P49790 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NUP153P49790 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NUP153P49790 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
NUP153P49790 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
NUP153P49790 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
NUP153P49790 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NUP153P49790 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
NUP153P49790 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NUP153P49790 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
NUP153P49790 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
NUP153P49790 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NUP153P49790 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NUP153P49790 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NUP153P49790 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NUP153P49790 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NUP153P49790 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NUP153P49790 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NUP153P49790 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NUP153P49790 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
NUP153P49790 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NUP153P49790 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NUP153P49790 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NUP153P49790 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NUP153P49790 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NUP153P49790 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NUP153P49790 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NUP153P49790 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NUP153P49790 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NUP153P49790 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NUP153P49790 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
NUP153P49790 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
NUP153P49790 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NUP153P49790 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NUP153P49790 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NUP153P49790 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NUP153P49790 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NUP153P49790 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NUP153P49790 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NUP153P49790 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NUP153P49790 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NUP153P49790 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
NUP153P49790 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NUP153P49790 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NUP153P49790 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NUP153P49790 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
NUP153P49790 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NUP153P49790 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NUP153P49790 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NUP153P49790 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NUP153P49790 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NUP153P49790 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NUP153P49790 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NUP153P49790 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NUP153P49790 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NUP153P49790 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NUP153P49790 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NUP153P49790 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NUP153P49790 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NUP153P49790 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
NUP153P49790 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms