Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PSEN1P49768 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSEN1P49768 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms