Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLK1P49759 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CLK1P49759 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLK1P49759 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLK1P49759 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLK1P49759 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLK1P49759 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLK1P49759 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLK1P49759 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLK1P49759 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLK1P49759 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLK1P49759 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLK1P49759 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLK1P49759 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLK1P49759 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLK1P49759 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLK1P49759 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLK1P49759 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLK1P49759 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLK1P49759 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLK1P49759 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLK1P49759 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLK1P49759 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLK1P49759 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLK1P49759 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLK1P49759 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLK1P49759 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLK1P49759 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLK1P49759 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLK1P49759 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLK1P49759 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLK1P49759 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLK1P49759 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLK1P49759 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CLK1P49759 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLK1P49759 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLK1P49759 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLK1P49759 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLK1P49759 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLK1P49759 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLK1P49759 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLK1P49759 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLK1P49759 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLK1P49759 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLK1P49759 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLK1P49759 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLK1P49759 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CLK1P49759 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLK1P49759 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CLK1P49759 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLK1P49759 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CLK1P49759 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLK1P49759 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLK1P49759 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLK1P49759 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLK1P49759 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLK1P49759 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLK1P49759 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLK1P49759 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLK1P49759 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLK1P49759 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLK1P49759 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLK1P49759 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLK1P49759 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLK1P49759 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLK1P49759 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLK1P49759 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLK1P49759 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLK1P49759 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLK1P49759 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLK1P49759 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLK1P49759 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLK1P49759 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLK1P49759 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLK1P49759 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLK1P49759 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLK1P49759 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLK1P49759 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLK1P49759 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLK1P49759 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLK1P49759 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLK1P49759 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLK1P49759 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLK1P49759 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLK1P49759 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLK1P49759 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLK1P49759 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLK1P49759 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CLK1P49759 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLK1P49759 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLK1P49759 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLK1P49759 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CLK1P49759 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLK1P49759 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLK1P49759 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLK1P49759 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLK1P49759 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLK1P49759 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLK1P49759 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CLK1P49759 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms