Protein–RNA interactions for Protein: P49019

HCAR3, Hydroxycarboxylic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR3P49019 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCAR3P49019 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HCAR3P49019 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms