Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRPC1P48995 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRPC1P48995 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms