Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NESP48681 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NESP48681 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NESP48681 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
NESP48681 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NESP48681 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NESP48681 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NESP48681 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
NESP48681 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NESP48681 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NESP48681 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NESP48681 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NESP48681 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NESP48681 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NESP48681 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NESP48681 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
NESP48681 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NESP48681 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
NESP48681 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NESP48681 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
NESP48681 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NESP48681 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NESP48681 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NESP48681 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NESP48681 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NESP48681 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NESP48681 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NESP48681 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NESP48681 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NESP48681 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NESP48681 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NESP48681 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NESP48681 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NESP48681 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NESP48681 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NESP48681 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NESP48681 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NESP48681 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NESP48681 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NESP48681 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NESP48681 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NESP48681 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NESP48681 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NESP48681 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NESP48681 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
NESP48681 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NESP48681 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NESP48681 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NESP48681 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC37.65■■■■□ 3.62
NESP48681 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
NESP48681 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
NESP48681 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NESP48681 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NESP48681 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NESP48681 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NESP48681 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NESP48681 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
NESP48681 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
NESP48681 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NESP48681 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NESP48681 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NESP48681 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NESP48681 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NESP48681 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
NESP48681 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
NESP48681 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
NESP48681 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NESP48681 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NESP48681 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NESP48681 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NESP48681 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NESP48681 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NESP48681 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NESP48681 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
NESP48681 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NESP48681 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NESP48681 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NESP48681 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NESP48681 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NESP48681 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NESP48681 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NESP48681 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NESP48681 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NESP48681 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NESP48681 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NESP48681 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NESP48681 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NESP48681 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NESP48681 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NESP48681 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NESP48681 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NESP48681 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NESP48681 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NESP48681 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NESP48681 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NESP48681 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NESP48681 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NESP48681 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NESP48681 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
NESP48681 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms