Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GRIA4P48058 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GRIA4P48058 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms