Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MTHFRP42898 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms