Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL35P42766 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL35P42766 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL35P42766 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL35P42766 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL35P42766 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL35P42766 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL35P42766 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL35P42766 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL35P42766 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL35P42766 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL35P42766 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL35P42766 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL35P42766 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL35P42766 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL35P42766 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL35P42766 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL35P42766 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL35P42766 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL35P42766 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL35P42766 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL35P42766 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL35P42766 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL35P42766 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL35P42766 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL35P42766 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL35P42766 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL35P42766 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL35P42766 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL35P42766 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL35P42766 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL35P42766 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL35P42766 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL35P42766 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL35P42766 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL35P42766 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL35P42766 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL35P42766 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL35P42766 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL35P42766 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL35P42766 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL35P42766 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL35P42766 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL35P42766 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL35P42766 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL35P42766 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL35P42766 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL35P42766 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL35P42766 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL35P42766 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL35P42766 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL35P42766 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL35P42766 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL35P42766 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL35P42766 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL35P42766 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL35P42766 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL35P42766 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL35P42766 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL35P42766 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL35P42766 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL35P42766 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL35P42766 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL35P42766 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL35P42766 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL35P42766 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL35P42766 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL35P42766 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL35P42766 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL35P42766 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL35P42766 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL35P42766 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL35P42766 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL35P42766 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL35P42766 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL35P42766 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL35P42766 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPL35P42766 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL35P42766 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL35P42766 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL35P42766 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL35P42766 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL35P42766 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL35P42766 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL35P42766 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL35P42766 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL35P42766 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL35P42766 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL35P42766 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL35P42766 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL35P42766 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL35P42766 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL35P42766 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL35P42766 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPL35P42766 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL35P42766 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL35P42766 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL35P42766 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL35P42766 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL35P42766 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms