Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PIK3CBP42338 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PIK3CBP42338 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms