Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THPOP40225 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THPOP40225 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THPOP40225 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
THPOP40225 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
THPOP40225 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THPOP40225 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THPOP40225 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
THPOP40225 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THPOP40225 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
THPOP40225 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
THPOP40225 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THPOP40225 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THPOP40225 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THPOP40225 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THPOP40225 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THPOP40225 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
THPOP40225 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
THPOP40225 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THPOP40225 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
THPOP40225 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THPOP40225 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
THPOP40225 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
THPOP40225 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
THPOP40225 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
THPOP40225 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THPOP40225 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THPOP40225 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THPOP40225 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THPOP40225 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THPOP40225 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THPOP40225 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THPOP40225 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THPOP40225 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THPOP40225 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THPOP40225 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THPOP40225 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THPOP40225 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THPOP40225 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THPOP40225 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THPOP40225 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THPOP40225 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
THPOP40225 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THPOP40225 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THPOP40225 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THPOP40225 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
THPOP40225 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THPOP40225 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THPOP40225 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
THPOP40225 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
THPOP40225 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THPOP40225 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THPOP40225 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THPOP40225 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THPOP40225 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THPOP40225 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THPOP40225 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THPOP40225 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THPOP40225 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THPOP40225 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THPOP40225 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THPOP40225 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THPOP40225 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THPOP40225 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THPOP40225 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THPOP40225 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THPOP40225 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THPOP40225 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
THPOP40225 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
THPOP40225 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THPOP40225 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THPOP40225 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THPOP40225 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THPOP40225 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THPOP40225 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THPOP40225 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THPOP40225 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THPOP40225 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
THPOP40225 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
THPOP40225 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THPOP40225 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THPOP40225 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
THPOP40225 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
THPOP40225 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
THPOP40225 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THPOP40225 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THPOP40225 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THPOP40225 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THPOP40225 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THPOP40225 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
THPOP40225 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THPOP40225 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THPOP40225 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THPOP40225 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
THPOP40225 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
THPOP40225 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
THPOP40225 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THPOP40225 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THPOP40225 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
THPOP40225 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms