Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGCXP38435 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGCXP38435 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGCXP38435 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGCXP38435 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGCXP38435 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GGCXP38435 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGCXP38435 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGCXP38435 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGCXP38435 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGCXP38435 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGCXP38435 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGCXP38435 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGCXP38435 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGCXP38435 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGCXP38435 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGCXP38435 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGCXP38435 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGCXP38435 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGCXP38435 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGCXP38435 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGCXP38435 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGCXP38435 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGCXP38435 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGCXP38435 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGCXP38435 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGCXP38435 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGCXP38435 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGCXP38435 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGCXP38435 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGCXP38435 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGCXP38435 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGCXP38435 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGCXP38435 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGCXP38435 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGCXP38435 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGCXP38435 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGCXP38435 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGCXP38435 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGCXP38435 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGCXP38435 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGCXP38435 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GGCXP38435 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGCXP38435 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GGCXP38435 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GGCXP38435 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGCXP38435 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGCXP38435 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GGCXP38435 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGCXP38435 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGCXP38435 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGCXP38435 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGCXP38435 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGCXP38435 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGCXP38435 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGCXP38435 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGCXP38435 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGCXP38435 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGCXP38435 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGCXP38435 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGCXP38435 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGCXP38435 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGCXP38435 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGCXP38435 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGCXP38435 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGCXP38435 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGCXP38435 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGCXP38435 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGCXP38435 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGCXP38435 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGCXP38435 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGCXP38435 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGCXP38435 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGCXP38435 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGCXP38435 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGCXP38435 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGCXP38435 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGCXP38435 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGCXP38435 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGCXP38435 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GGCXP38435 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GGCXP38435 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GGCXP38435 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GGCXP38435 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GGCXP38435 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
GGCXP38435 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGCXP38435 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGCXP38435 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGCXP38435 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGCXP38435 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGCXP38435 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGCXP38435 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGCXP38435 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGCXP38435 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGCXP38435 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GGCXP38435 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGCXP38435 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGCXP38435 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GGCXP38435 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GGCXP38435 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms