Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRNA7P36544 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms