Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIM23P36406 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM23P36406 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms