Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MYH11P35749 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MYH11P35749 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MYH11P35749 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MYH11P35749 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYH11P35749 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYH11P35749 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYH11P35749 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYH11P35749 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MYH11P35749 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH11P35749 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH11P35749 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH11P35749 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH11P35749 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH11P35749 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH11P35749 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH11P35749 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH11P35749 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH11P35749 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH11P35749 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH11P35749 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH11P35749 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH11P35749 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH11P35749 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH11P35749 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH11P35749 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYH11P35749 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYH11P35749 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYH11P35749 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYH11P35749 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYH11P35749 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYH11P35749 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYH11P35749 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH11P35749 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH11P35749 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH11P35749 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH11P35749 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH11P35749 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH11P35749 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH11P35749 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH11P35749 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH11P35749 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH11P35749 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH11P35749 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH11P35749 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH11P35749 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH11P35749 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH11P35749 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH11P35749 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH11P35749 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH11P35749 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH11P35749 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH11P35749 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYH11P35749 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYH11P35749 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYH11P35749 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYH11P35749 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYH11P35749 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYH11P35749 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYH11P35749 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYH11P35749 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH11P35749 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH11P35749 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH11P35749 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH11P35749 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH11P35749 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH11P35749 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH11P35749 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH11P35749 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH11P35749 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH11P35749 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH11P35749 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH11P35749 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH11P35749 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH11P35749 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH11P35749 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH11P35749 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH11P35749 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH11P35749 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH11P35749 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYH11P35749 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYH11P35749 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYH11P35749 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
MYH11P35749 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYH11P35749 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYH11P35749 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYH11P35749 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYH11P35749 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYH11P35749 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYH11P35749 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH11P35749 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH11P35749 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH11P35749 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH11P35749 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH11P35749 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH11P35749 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH11P35749 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH11P35749 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH11P35749 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYH11P35749 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms