Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT9P35527 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT9P35527 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT9P35527 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT9P35527 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT9P35527 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT9P35527 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT9P35527 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT9P35527 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT9P35527 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT9P35527 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT9P35527 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT9P35527 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT9P35527 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT9P35527 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT9P35527 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT9P35527 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT9P35527 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT9P35527 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT9P35527 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT9P35527 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT9P35527 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT9P35527 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT9P35527 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT9P35527 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT9P35527 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT9P35527 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT9P35527 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT9P35527 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT9P35527 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT9P35527 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT9P35527 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT9P35527 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT9P35527 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT9P35527 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT9P35527 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT9P35527 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT9P35527 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT9P35527 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT9P35527 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT9P35527 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT9P35527 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT9P35527 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT9P35527 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT9P35527 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT9P35527 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT9P35527 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT9P35527 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT9P35527 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT9P35527 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT9P35527 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT9P35527 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT9P35527 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT9P35527 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT9P35527 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT9P35527 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT9P35527 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT9P35527 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT9P35527 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT9P35527 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT9P35527 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT9P35527 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT9P35527 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT9P35527 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT9P35527 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT9P35527 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT9P35527 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT9P35527 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT9P35527 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT9P35527 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT9P35527 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT9P35527 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT9P35527 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT9P35527 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT9P35527 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms