Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNA1P35221 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNA1P35221 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms