Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJA4P35212 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA4P35212 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA4P35212 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA4P35212 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA4P35212 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA4P35212 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA4P35212 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA4P35212 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA4P35212 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA4P35212 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA4P35212 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA4P35212 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA4P35212 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA4P35212 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA4P35212 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA4P35212 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJA4P35212 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA4P35212 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA4P35212 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA4P35212 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA4P35212 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA4P35212 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA4P35212 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA4P35212 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA4P35212 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA4P35212 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA4P35212 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA4P35212 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA4P35212 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA4P35212 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA4P35212 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GJA4P35212 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA4P35212 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA4P35212 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA4P35212 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA4P35212 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA4P35212 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA4P35212 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA4P35212 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA4P35212 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA4P35212 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA4P35212 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA4P35212 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA4P35212 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA4P35212 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA4P35212 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GJA4P35212 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJA4P35212 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJA4P35212 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GJA4P35212 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA4P35212 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA4P35212 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA4P35212 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA4P35212 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA4P35212 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA4P35212 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GJA4P35212 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA4P35212 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA4P35212 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA4P35212 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA4P35212 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA4P35212 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA4P35212 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA4P35212 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA4P35212 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA4P35212 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA4P35212 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA4P35212 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA4P35212 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GJA4P35212 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA4P35212 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA4P35212 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA4P35212 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA4P35212 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA4P35212 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA4P35212 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA4P35212 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA4P35212 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA4P35212 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA4P35212 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA4P35212 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA4P35212 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA4P35212 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA4P35212 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA4P35212 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA4P35212 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA4P35212 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA4P35212 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA4P35212 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA4P35212 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA4P35212 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GJA4P35212 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA4P35212 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA4P35212 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA4P35212 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA4P35212 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA4P35212 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA4P35212 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GJA4P35212 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms