Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ABCD1P33897 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABCD1P33897 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABCD1P33897 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms