Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC12P31275 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC12P31275 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms