Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXC8P31273 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC8P31273 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms