Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXA7P31268 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXA7P31268 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms