Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRIP30626 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRIP30626 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRIP30626 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRIP30626 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRIP30626 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRIP30626 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRIP30626 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRIP30626 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRIP30626 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRIP30626 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRIP30626 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRIP30626 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRIP30626 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRIP30626 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRIP30626 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRIP30626 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRIP30626 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRIP30626 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRIP30626 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRIP30626 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRIP30626 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRIP30626 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRIP30626 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRIP30626 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRIP30626 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRIP30626 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRIP30626 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRIP30626 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRIP30626 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRIP30626 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRIP30626 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRIP30626 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRIP30626 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRIP30626 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRIP30626 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRIP30626 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRIP30626 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRIP30626 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRIP30626 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRIP30626 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRIP30626 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRIP30626 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRIP30626 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRIP30626 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRIP30626 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRIP30626 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRIP30626 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRIP30626 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRIP30626 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRIP30626 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRIP30626 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRIP30626 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRIP30626 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRIP30626 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRIP30626 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRIP30626 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRIP30626 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRIP30626 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRIP30626 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRIP30626 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRIP30626 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRIP30626 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRIP30626 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRIP30626 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRIP30626 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRIP30626 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRIP30626 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRIP30626 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRIP30626 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRIP30626 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRIP30626 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRIP30626 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRIP30626 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRIP30626 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRIP30626 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRIP30626 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRIP30626 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRIP30626 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRIP30626 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRIP30626 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRIP30626 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRIP30626 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRIP30626 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRIP30626 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRIP30626 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRIP30626 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRIP30626 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRIP30626 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRIP30626 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRIP30626 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRIP30626 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRIP30626 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRIP30626 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRIP30626 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRIP30626 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRIP30626 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRIP30626 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRIP30626 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRIP30626 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms