Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCND3P30281 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCND3P30281 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCND3P30281 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCND3P30281 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCND3P30281 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCND3P30281 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCND3P30281 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCND3P30281 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCND3P30281 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCND3P30281 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCND3P30281 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCND3P30281 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCND3P30281 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCND3P30281 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCND3P30281 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCND3P30281 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCND3P30281 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCND3P30281 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCND3P30281 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCND3P30281 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCND3P30281 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCND3P30281 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCND3P30281 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCND3P30281 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCND3P30281 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCND3P30281 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCND3P30281 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCND3P30281 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCND3P30281 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCND3P30281 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCND3P30281 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCND3P30281 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCND3P30281 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCND3P30281 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCND3P30281 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCND3P30281 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCND3P30281 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCND3P30281 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCND3P30281 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCND3P30281 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCND3P30281 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCND3P30281 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCND3P30281 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCND3P30281 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCND3P30281 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCND3P30281 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCND3P30281 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCND3P30281 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCND3P30281 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCND3P30281 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCND3P30281 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCND3P30281 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCND3P30281 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCND3P30281 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCND3P30281 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCND3P30281 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCND3P30281 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCND3P30281 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCND3P30281 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCND3P30281 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCND3P30281 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCND3P30281 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCND3P30281 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCND3P30281 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCND3P30281 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCND3P30281 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCND3P30281 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCND3P30281 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCND3P30281 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND3P30281 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND3P30281 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND3P30281 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND3P30281 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND3P30281 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND3P30281 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND3P30281 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND3P30281 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND3P30281 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND3P30281 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND3P30281 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND3P30281 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND3P30281 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND3P30281 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCND3P30281 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND3P30281 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND3P30281 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND3P30281 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND3P30281 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND3P30281 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND3P30281 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND3P30281 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND3P30281 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND3P30281 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND3P30281 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND3P30281 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND3P30281 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND3P30281 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND3P30281 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCND3P30281 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms