Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNGA1P29973 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNGA1P29973 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms