Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP1P29466 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP1P29466 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP1P29466 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP1P29466 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP1P29466 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP1P29466 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP1P29466 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP1P29466 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP1P29466 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP1P29466 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP1P29466 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP1P29466 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP1P29466 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP1P29466 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP1P29466 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP1P29466 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP1P29466 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP1P29466 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP1P29466 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP1P29466 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP1P29466 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP1P29466 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP1P29466 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP1P29466 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP1P29466 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP1P29466 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP1P29466 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP1P29466 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP1P29466 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP1P29466 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP1P29466 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP1P29466 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP1P29466 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP1P29466 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP1P29466 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP1P29466 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP1P29466 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CASP1P29466 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP1P29466 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP1P29466 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CASP1P29466 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP1P29466 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP1P29466 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP1P29466 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP1P29466 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP1P29466 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP1P29466 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP1P29466 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP1P29466 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP1P29466 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP1P29466 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP1P29466 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP1P29466 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP1P29466 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP1P29466 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP1P29466 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP1P29466 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP1P29466 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP1P29466 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP1P29466 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP1P29466 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP1P29466 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP1P29466 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP1P29466 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP1P29466 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP1P29466 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP1P29466 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP1P29466 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP1P29466 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP1P29466 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP1P29466 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP1P29466 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP1P29466 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP1P29466 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP1P29466 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP1P29466 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP1P29466 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP1P29466 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP1P29466 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP1P29466 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP1P29466 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP1P29466 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP1P29466 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP1P29466 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP1P29466 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP1P29466 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP1P29466 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP1P29466 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP1P29466 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP1P29466 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP1P29466 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP1P29466 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP1P29466 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP1P29466 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP1P29466 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP1P29466 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP1P29466 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP1P29466 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CASP1P29466 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms