Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLD1P28340 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLD1P28340 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLD1P28340 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLD1P28340 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLD1P28340 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLD1P28340 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLD1P28340 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLD1P28340 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLD1P28340 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLD1P28340 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLD1P28340 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLD1P28340 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLD1P28340 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLD1P28340 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLD1P28340 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLD1P28340 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLD1P28340 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLD1P28340 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLD1P28340 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLD1P28340 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLD1P28340 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLD1P28340 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
POLD1P28340 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
POLD1P28340 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLD1P28340 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLD1P28340 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLD1P28340 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLD1P28340 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLD1P28340 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLD1P28340 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLD1P28340 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLD1P28340 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLD1P28340 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLD1P28340 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLD1P28340 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLD1P28340 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLD1P28340 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLD1P28340 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLD1P28340 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLD1P28340 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLD1P28340 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLD1P28340 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLD1P28340 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLD1P28340 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLD1P28340 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLD1P28340 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLD1P28340 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLD1P28340 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLD1P28340 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLD1P28340 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLD1P28340 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLD1P28340 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLD1P28340 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLD1P28340 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLD1P28340 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLD1P28340 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLD1P28340 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLD1P28340 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLD1P28340 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLD1P28340 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
POLD1P28340 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLD1P28340 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLD1P28340 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLD1P28340 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLD1P28340 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLD1P28340 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLD1P28340 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLD1P28340 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLD1P28340 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLD1P28340 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLD1P28340 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLD1P28340 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLD1P28340 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLD1P28340 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLD1P28340 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLD1P28340 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLD1P28340 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLD1P28340 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLD1P28340 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLD1P28340 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLD1P28340 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLD1P28340 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLD1P28340 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLD1P28340 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLD1P28340 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLD1P28340 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLD1P28340 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
POLD1P28340 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
POLD1P28340 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLD1P28340 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
POLD1P28340 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLD1P28340 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLD1P28340 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
POLD1P28340 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLD1P28340 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLD1P28340 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLD1P28340 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLD1P28340 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLD1P28340 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms