Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFKBIAP25963 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFKBIAP25963 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms