Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTSSP25774 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTSSP25774 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTSSP25774 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTSSP25774 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTSSP25774 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTSSP25774 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTSSP25774 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTSSP25774 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTSSP25774 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTSSP25774 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTSSP25774 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTSSP25774 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTSSP25774 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTSSP25774 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTSSP25774 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTSSP25774 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTSSP25774 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTSSP25774 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTSSP25774 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTSSP25774 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTSSP25774 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTSSP25774 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CTSSP25774 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTSSP25774 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTSSP25774 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTSSP25774 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTSSP25774 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTSSP25774 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CTSSP25774 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTSSP25774 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CTSSP25774 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CTSSP25774 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTSSP25774 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTSSP25774 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTSSP25774 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTSSP25774 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTSSP25774 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTSSP25774 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTSSP25774 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTSSP25774 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTSSP25774 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTSSP25774 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTSSP25774 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTSSP25774 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTSSP25774 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTSSP25774 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTSSP25774 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTSSP25774 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTSSP25774 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTSSP25774 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTSSP25774 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTSSP25774 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTSSP25774 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTSSP25774 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTSSP25774 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTSSP25774 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTSSP25774 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTSSP25774 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTSSP25774 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTSSP25774 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTSSP25774 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTSSP25774 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTSSP25774 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTSSP25774 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTSSP25774 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTSSP25774 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTSSP25774 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTSSP25774 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTSSP25774 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTSSP25774 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTSSP25774 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTSSP25774 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTSSP25774 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTSSP25774 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTSSP25774 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTSSP25774 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTSSP25774 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CTSSP25774 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTSSP25774 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTSSP25774 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTSSP25774 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTSSP25774 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTSSP25774 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTSSP25774 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTSSP25774 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTSSP25774 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTSSP25774 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTSSP25774 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTSSP25774 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTSSP25774 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTSSP25774 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTSSP25774 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTSSP25774 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTSSP25774 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTSSP25774 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTSSP25774 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTSSP25774 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTSSP25774 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTSSP25774 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms