Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL9A1P20849 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms