Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMNB1P20700 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LMNB1P20700 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms