Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
TRHP20396 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
TRHP20396 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TRHP20396 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRHP20396 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRHP20396 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRHP20396 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRHP20396 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TRHP20396 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRHP20396 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRHP20396 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRHP20396 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRHP20396 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRHP20396 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
TRHP20396 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRHP20396 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRHP20396 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRHP20396 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRHP20396 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TRHP20396 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRHP20396 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRHP20396 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
TRHP20396 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRHP20396 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRHP20396 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRHP20396 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRHP20396 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TRHP20396 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRHP20396 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRHP20396 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRHP20396 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
TRHP20396 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRHP20396 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRHP20396 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRHP20396 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRHP20396 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRHP20396 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRHP20396 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRHP20396 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRHP20396 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRHP20396 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRHP20396 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRHP20396 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TRHP20396 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRHP20396 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRHP20396 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRHP20396 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRHP20396 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRHP20396 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRHP20396 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TRHP20396 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRHP20396 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRHP20396 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRHP20396 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRHP20396 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRHP20396 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRHP20396 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRHP20396 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRHP20396 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRHP20396 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
TRHP20396 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRHP20396 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRHP20396 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TRHP20396 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TRHP20396 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TRHP20396 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TRHP20396 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TRHP20396 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
TRHP20396 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
TRHP20396 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.82■■■■□ 3
TRHP20396 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TRHP20396 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TRHP20396 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TRHP20396 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
TRHP20396 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TRHP20396 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC33.81■■■■□ 3
TRHP20396 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC33.81■■■■□ 3
TRHP20396 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TRHP20396 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TRHP20396 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
TRHP20396 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TRHP20396 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TRHP20396 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
TRHP20396 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TRHP20396 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TRHP20396 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TRHP20396 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRHP20396 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRHP20396 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC33.79■■■■□ 3
TRHP20396 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
TRHP20396 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRHP20396 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TRHP20396 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TRHP20396 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TRHP20396 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
TRHP20396 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TRHP20396 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TRHP20396 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TRHP20396 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TRHP20396 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms