Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP2B1P20020 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP2B1P20020 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms