Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL17P18621 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL17P18621 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL17P18621 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL17P18621 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL17P18621 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL17P18621 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL17P18621 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL17P18621 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL17P18621 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL17P18621 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL17P18621 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL17P18621 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL17P18621 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL17P18621 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL17P18621 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL17P18621 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL17P18621 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL17P18621 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL17P18621 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL17P18621 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL17P18621 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL17P18621 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL17P18621 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL17P18621 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL17P18621 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL17P18621 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL17P18621 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL17P18621 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL17P18621 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL17P18621 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL17P18621 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL17P18621 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL17P18621 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL17P18621 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL17P18621 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL17P18621 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL17P18621 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL17P18621 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL17P18621 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL17P18621 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL17P18621 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL17P18621 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL17P18621 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL17P18621 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL17P18621 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL17P18621 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL17P18621 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL17P18621 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL17P18621 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL17P18621 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL17P18621 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL17P18621 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL17P18621 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL17P18621 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL17P18621 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL17P18621 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL17P18621 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL17P18621 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL17P18621 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL17P18621 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL17P18621 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL17P18621 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL17P18621 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL17P18621 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL17P18621 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL17P18621 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL17P18621 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL17P18621 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL17P18621 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPL17P18621 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPL17P18621 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPL17P18621 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL17P18621 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL17P18621 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL17P18621 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL17P18621 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL17P18621 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL17P18621 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL17P18621 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL17P18621 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL17P18621 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL17P18621 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL17P18621 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL17P18621 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL17P18621 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL17P18621 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL17P18621 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL17P18621 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL17P18621 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL17P18621 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL17P18621 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL17P18621 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL17P18621 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL17P18621 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL17P18621 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL17P18621 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL17P18621 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL17P18621 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL17P18621 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms