Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EGR1P18146 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR1P18146 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR1P18146 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR1P18146 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR1P18146 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR1P18146 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR1P18146 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR1P18146 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR1P18146 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR1P18146 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR1P18146 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR1P18146 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR1P18146 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR1P18146 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR1P18146 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EGR1P18146 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR1P18146 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR1P18146 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR1P18146 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR1P18146 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR1P18146 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR1P18146 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR1P18146 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR1P18146 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR1P18146 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR1P18146 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR1P18146 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR1P18146 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR1P18146 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EGR1P18146 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR1P18146 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR1P18146 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR1P18146 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR1P18146 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR1P18146 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR1P18146 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR1P18146 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR1P18146 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR1P18146 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR1P18146 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR1P18146 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR1P18146 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR1P18146 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR1P18146 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR1P18146 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR1P18146 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR1P18146 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EGR1P18146 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR1P18146 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR1P18146 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR1P18146 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR1P18146 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR1P18146 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR1P18146 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR1P18146 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR1P18146 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR1P18146 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR1P18146 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR1P18146 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR1P18146 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR1P18146 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR1P18146 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR1P18146 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR1P18146 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR1P18146 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR1P18146 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR1P18146 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR1P18146 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR1P18146 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
EGR1P18146 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
EGR1P18146 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
EGR1P18146 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR1P18146 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR1P18146 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR1P18146 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR1P18146 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR1P18146 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR1P18146 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR1P18146 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR1P18146 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR1P18146 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR1P18146 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR1P18146 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR1P18146 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR1P18146 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
EGR1P18146 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR1P18146 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR1P18146 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR1P18146 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR1P18146 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR1P18146 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR1P18146 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR1P18146 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR1P18146 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR1P18146 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR1P18146 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR1P18146 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR1P18146 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
EGR1P18146 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms