Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNB2P17787 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNB2P17787 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms