Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DESP17661 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DESP17661 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DESP17661 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DESP17661 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DESP17661 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DESP17661 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DESP17661 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DESP17661 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DESP17661 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DESP17661 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DESP17661 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DESP17661 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DESP17661 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DESP17661 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DESP17661 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DESP17661 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DESP17661 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DESP17661 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DESP17661 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DESP17661 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DESP17661 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DESP17661 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DESP17661 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DESP17661 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DESP17661 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DESP17661 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DESP17661 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DESP17661 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DESP17661 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DESP17661 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DESP17661 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DESP17661 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DESP17661 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DESP17661 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DESP17661 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DESP17661 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DESP17661 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DESP17661 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DESP17661 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DESP17661 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DESP17661 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DESP17661 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DESP17661 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DESP17661 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DESP17661 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DESP17661 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DESP17661 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DESP17661 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DESP17661 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DESP17661 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DESP17661 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DESP17661 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DESP17661 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DESP17661 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DESP17661 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DESP17661 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DESP17661 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DESP17661 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DESP17661 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DESP17661 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DESP17661 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DESP17661 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DESP17661 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DESP17661 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DESP17661 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DESP17661 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DESP17661 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DESP17661 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DESP17661 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DESP17661 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DESP17661 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DESP17661 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DESP17661 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DESP17661 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DESP17661 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DESP17661 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DESP17661 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DESP17661 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DESP17661 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DESP17661 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DESP17661 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DESP17661 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DESP17661 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DESP17661 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DESP17661 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DESP17661 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DESP17661 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DESP17661 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DESP17661 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DESP17661 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DESP17661 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DESP17661 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DESP17661 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DESP17661 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DESP17661 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DESP17661 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DESP17661 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DESP17661 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DESP17661 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms