Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN2P17655 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms