Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF7P17544 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATF7P17544 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF7P17544 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF7P17544 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF7P17544 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF7P17544 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF7P17544 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF7P17544 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF7P17544 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF7P17544 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF7P17544 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF7P17544 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF7P17544 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF7P17544 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF7P17544 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF7P17544 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF7P17544 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF7P17544 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF7P17544 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF7P17544 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF7P17544 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF7P17544 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF7P17544 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATF7P17544 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ATF7P17544 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF7P17544 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF7P17544 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF7P17544 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF7P17544 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF7P17544 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF7P17544 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF7P17544 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF7P17544 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF7P17544 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF7P17544 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF7P17544 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF7P17544 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF7P17544 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF7P17544 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF7P17544 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF7P17544 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF7P17544 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF7P17544 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF7P17544 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF7P17544 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF7P17544 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF7P17544 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF7P17544 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF7P17544 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF7P17544 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF7P17544 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF7P17544 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF7P17544 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF7P17544 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF7P17544 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF7P17544 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF7P17544 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF7P17544 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF7P17544 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF7P17544 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF7P17544 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF7P17544 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF7P17544 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF7P17544 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF7P17544 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF7P17544 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF7P17544 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF7P17544 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF7P17544 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF7P17544 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF7P17544 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF7P17544 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF7P17544 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF7P17544 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF7P17544 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF7P17544 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF7P17544 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF7P17544 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF7P17544 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF7P17544 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF7P17544 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF7P17544 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF7P17544 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF7P17544 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF7P17544 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF7P17544 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF7P17544 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF7P17544 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF7P17544 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF7P17544 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF7P17544 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF7P17544 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF7P17544 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF7P17544 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF7P17544 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF7P17544 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF7P17544 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATF7P17544 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATF7P17544 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms