Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOT1P17174 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOT1P17174 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOT1P17174 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOT1P17174 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOT1P17174 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOT1P17174 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOT1P17174 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOT1P17174 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOT1P17174 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOT1P17174 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOT1P17174 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOT1P17174 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOT1P17174 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOT1P17174 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GOT1P17174 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOT1P17174 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOT1P17174 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOT1P17174 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOT1P17174 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOT1P17174 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOT1P17174 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOT1P17174 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOT1P17174 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOT1P17174 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOT1P17174 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOT1P17174 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOT1P17174 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOT1P17174 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOT1P17174 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GOT1P17174 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOT1P17174 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOT1P17174 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOT1P17174 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOT1P17174 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOT1P17174 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOT1P17174 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GOT1P17174 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOT1P17174 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOT1P17174 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOT1P17174 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GOT1P17174 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOT1P17174 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOT1P17174 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOT1P17174 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOT1P17174 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOT1P17174 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOT1P17174 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOT1P17174 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOT1P17174 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOT1P17174 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOT1P17174 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOT1P17174 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOT1P17174 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOT1P17174 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GOT1P17174 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOT1P17174 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOT1P17174 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOT1P17174 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GOT1P17174 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOT1P17174 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOT1P17174 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOT1P17174 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOT1P17174 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOT1P17174 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GOT1P17174 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOT1P17174 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOT1P17174 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOT1P17174 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOT1P17174 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOT1P17174 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOT1P17174 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOT1P17174 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOT1P17174 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOT1P17174 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOT1P17174 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOT1P17174 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOT1P17174 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOT1P17174 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOT1P17174 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GOT1P17174 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOT1P17174 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOT1P17174 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOT1P17174 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOT1P17174 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GOT1P17174 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOT1P17174 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOT1P17174 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GOT1P17174 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOT1P17174 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOT1P17174 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOT1P17174 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOT1P17174 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOT1P17174 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GOT1P17174 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOT1P17174 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOT1P17174 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOT1P17174 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOT1P17174 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOT1P17174 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms